穆罕默德·阿西夫·拉希德
ApoE4 是一种主要的遗传风险因素,因为它会增加患阿尔茨海默病的几率。这项研究旨在预测此类化合物,它们可能有助于设计药物来抑制 ApoE4 蛋白的过度活性。22 种天然化合物(海洋、微生物和植物衍生物)被用作抑制剂,并与 ApoE4 对接(PDB id 1B68)。6 种合成化合物(在临床试验中)与靶蛋白对接,以比较和分析与天然化合物的对接结果。化合物 S-烯丙基-L-半胱氨酸、表儿茶素没食子酸酯和富里酸分别表现出高结合亲和力,即 -7.1、- 7 和 -7。表儿茶素没食子酸酯与 Gln156 和 Asp35 形成氢键,富里酸与 Glu27 形成氢键。对于合成化合物,Tideglusib 未与 ApoE4 的任何氨基酸残基形成氢键,但显示出 -7.2 的高结合亲和力,这与天然化合物 S-烯丙基-L-半胱氨酸相同,后者显示出 -7.1 的高结合亲和力,但未与任何氨基酸残基形成氢键。ApoE4 的蛋白质-蛋白质相互作用显示与相关蛋白质的物理和功能相互作用。我们的研究根据结合亲和力和与氨基酸残基的氢键预测化合物表儿茶素没食子酸酯是可用作抑制剂的潜在先导化合物。