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抽象的

循環無細胞腫瘤 DNA 的液體活檢監測和癌症基因變異的鑑定以實現精確診斷

麥可·J·鮑威爾

目前臨床上可用的用於檢測核酸變異的分子測試，尤其是對生物液體（例如患者血漿）中存在的循環無細胞核酸進行的分子測試，其靈敏度有限。為了實現僅檢測大量非目標分子（野生型等位基因）中存在的少數目標分子（突變等位基因）的高靈敏度，複雜的方法需要昂貴的儀器、高技能的操作員以及在某些情況下需要密集的計算大型臨床研究中心正在採用數位液滴 PCR (ddPCR)、BEAMing PCR 和下一代深度定序 (NGS) 等生物資訊方法。這些方法的可用性有限、成本高且分析時間長，促使我們開發一種新技術，該技術可以由現有病理學人員在全球範圍內使用每個醫院病理學實驗室已有的儀器來執行。這項創新技術的核心是新的分子核酸類似物：異核酸(XNA)，它擁有DNA 中存在的所有天然鹼基，附加到新穎的化學主鏈上，以精緻的特異性和極其強烈的結合吸收這些寡聚核酸結合分子互補標靶序列的親和力。 XNA 結合的序列中的任何變化都會產生結合異常的差異熱力學自由能，該異常已被用來開發基於目標擴增的實時qPCR 和極高靈敏度的NGS 以及基於微珠的雜交捕獲測定，這些測定可檢測到少至從組織活檢或血漿循環無細胞 DNA (cfDNA) 中獲得的 DNA 中存在大量過量的野生型模板，其中有 2 個變異模板拷貝。已開發和驗證的商業CE/IVD 認證產品包括基於QClampTM 基因特異性實時qPCR 的測試、稱為ColoScapeTM 的新型結直腸癌檢測測試、稱為OptiSeqTM 的基於高靈敏度擴增子的目標NGS 平台以及針對癌症的多重目標擴增子雜交捕獲技術。本演講將討論這項突破性的新技術及其提供的精準診斷和標靶治療機會。